El equipo de EMPAGUA realiza la limpieza de agua utilizada por parte de los usuarios, la cual lleva un tratamiento previo antes de ser devuelto de forma segura al medio ambiente. Durante el proceso se eliminan algunos desechos sólidos y partículas más pequeñas que se encuentran en el agua residual.

Con el objetivo de la conservación de medio ambiente, la Empresa Municipal de Agua de la Ciudad de Guatemala – EMPAGUA-, cuenta con 5 Plantas de Tratamiento de Aguas Residuales (PTAR’s): ubicadas en Hacienda Real zona 16, Bellos Horizontes y Nimajuyú en zona 21.