Las aguas residuales, provenientes de viviendas y comercios, son aquellas que han sido utilizadas por los usuarios. Antes de ser liberadas en los ríos, estas aguas pasan por un proceso de tratamiento que se basa principalmente en tecnología anaerobia con el fin de mejorar la calidad del agua.

Con el firme propósito de preservar y cuidar el medio ambiente, EMPAGUA gestiona la operación de seis Plantas de Tratamiento de Aguas Residuales (PTAR) ubicadas en diferentes zonas: